АНАЛИЗ МУЛЬТИГЕННЫХ СЕМЕЙСТВ ВИРУСА АФРИКАНСКОЙ ЧУМЫ СВИНЕЙ
DOI 10.12737/2782-490X-2023-66-70 УДК 636.082:577.21
Ключевые слова:
африканская чума свиней, домашние свиньи, дикие кабаны, мульти генные семействаАннотация
В статье представлены обобщенные данные о мультигенных семействах виру
са (МГС) африканской чумы свиней. Особенностью вируса АЧС является наличие большого ко
личества мультигенных семейств. Общепризнано, что белки мультигенного семейства широко
распространены в геноме вируса африканской чумы свиней (АЧС) и обычно подразделяются на
пять семейств, включая MGF-100, MGF-110, MGF-300, MGF-360 и MGF-505. Мультигенные се
мейства вируса АЧС располагаются как в левой, так и правой вариабельных областях генома.
Известно, что мультигенные семейства 110 и 300 расположены на левом концевом участке, а
МГС 100 на правом, а МГС360, МГС505 и МГС530 на обоих концах генома. Большинство
МГС семейств имеют копии на каждом конце генома. Мультигенные семейства отвечают за ви
рулентность и репликацию вируса АЧС. Несколько генов, относящихся к семействам 360 и
505/530 определяют круг хозяев вируса АЧС и его вирулентность. Мультигенные семейства
530 содержит шесть различных рамок считывания, кодирующих в среднем пятьсот тридцать ами
нокислот, содержащих четыре высоко консервативных домена. МГС300 состоит из трех откры
тых рамок трансляции, кодирующих в среднем триста аминокислот, содержащих три высококон
сервативных домена. Аминоконцевые области белков, кодируемых МГС-530 и 300, имеют значи
тельное сходством друг с другом, а также с соответствующими областями.Большинство исследо
вателей считают, что МГС эволюционировали с помощью процесса удвоения и расхождения
последовательности. Элементы мультигенных семейств расположены близко к друг другу и счи
тываются только в одном направлении.
Библиографические ссылки
Африканская чума свиней в Российской Федерации (2007–2012 гг.): эпидемиологический обзор и последствия для стран Европы. Документ ФАО / А. Гогин, А. Середа и др. Рим, 2014. № 178. С. 87.
Степанов Д. В., Горячева М. М. Эпизоотология африканской чумы свиней в России // Наука: прошлое,
настоящее, будущее. 2017. С. 55-60.
The African Swine Fever Virus Transcriptome / G. Cackett, D. Matelska, M. Sykora, et al. // J Virol. 2020.
:e00119–20. http:// doi.org/10.1128/JVI.00119-20
An Update on African Swine Fever Virology / A. Karger, D. Perez-Nunez, J. Urquiza et al. // Viruses. 2019. Vol.
No. 9. pp. 864. http:// doi.org/10.3390/v11090864.
Genetic Characterization of African Swine Fever Virus Isolates From Soft Ticks at the Wildlife/Domestic Interface
in Mozambique and Identification of a Novel Genotype/ C. J. Quembo, F. Jori, W. Vosloo, et al. // Transbound Emerg Dis.
Vol. 65. pp. 420–431. http:// doi.org/10.1111/tbed.12700.
Two novel multigene families, 530 and 300, in the terminal variable regions of African swine fever virus genome /
T. Yozawa, G. F. Kutish, C. L. Afonso, et al. // Virology. 1994. Vol. 202. No 2. pp. 997-1002. http://doi.org/10.1006/
viro.1994.1426.
Biological characterization of African swine fever virus genotype II strains from north-eastern Estonia in European
wild boar / I. Nurmoja, A. Petrov, C. Breidenstein, et al. // Transbound. Emerg. Dis. 2017. Vol. 64. No.6. pp. 2034-2041.
http:// doi.org/10.1111/tbed.12614.
African swine fever virus Georgia isolate harboring deletions of 9GL and MGF360/505 genes is highly attenuated
in swine but does not confer protection against parental virus challenge / V. O' Donnell, L. G. Holinka, B. Sanford, et al. //
Virus Res. 2016. Vol. 221. pp. 8-14. http:// doi.org/10.1016/j.virusres.2016.05.014.
Evolution of African swine fever virus genes related to evasion of host immune response / M. Fraczyk, G. Wozniakowski, A. Kowalczyk, et al. // Vet. Microbiol. 2016. Vol. 193. pp. 133-144. http:// doi.org/10.1016/j.vetmic.2016.08.018.
Approaches and perspectives for development of african swine fever virus vaccines/ M. Arias, Ana de la Torre, A.
Dixon, et al. // Vaccines. 2017. Vol. 5. No 4. pp. 35. http:// doi.org/10.3390/vaccines5040035.
Analysis of the complete nucleotide sequence of African swine fever virus / R. J. Yáñez, J. M. Rodríguez, M. L.
Nogal, et al. // Virology. 2008. Vol. 208. No 1. :e01760-16. pp. 249-78. http:// doi.org/10.1006/viro.1995.1149.
Simultaneous deletion of the 9GL and UK genes from the African swine fever virus Georgia 2007 isolate offers
increased safety and protection against homologous challenge / V. O’Donnell, G. R. Risatti, L. G. Holinka, et al. // J. Virol. 2016. Vol. 91. No 1. e01760–16. http:// doi.org/10.1128/JVI.01760-16.
Середа А. Д., Колбасов Д. В. Белки вируса африканской чумы свиней // Научный журнал Кубанского ГАУ.
Т. 3. № 77. С. 534-550.
Селянинов Ю. О., Сенечкина Е. К. Физическое картирование генома вируса африканской чумы свиней //
Доклады РАСХН. 1995. № 2. С. 37-39.
Селянинов Ю. О., Балышев В. М., Цыбанов С. Ж. Вирус африканской чумы свиней: физическое картирование генома штаммов // Вестник российской сельскохозяйственной науки. 2000. №5. С. 75-76.
The progressive adaptation of a Georgian isolate of african swine fever virus to Vero cells leads to a gradual attenuation of virulence in swine corresponding to major modification sof the viral genome / P. W. Krug, L. G. Holinka, V.
O’Donnell, et al. // J. Virol. 2015. Vol. 89. Nо. 4. pp. 2324-2332. http:// doi.org/10.1128/JVI.03250-14.
Comparison of the genome sequences of non-pathogenic and pathogenic African swine fever virus isolates / D. A.
G. Chapman, V. Tcherepanov, C. Upton, et al. // J. Gen. Virol. 2008. Vol. 89. No 2. pp. 397-408. http:// doi.org/
1099/vir.0.83343-0.
African swine fever virus Georgia isolate harboring deletions of MGF360 and MGF505 genes is attenuated in
swine and confers protection against challenge with virulent parental virus / V. O’Donnell, L. G. Holinka, D. P. Gladue, et
al. // J. Virol. 2015. Vol. 89. No 11. pp. 6048 - 6056. http://doi.org/ 10.1128/JVI.00554-15.
Malogolovkin A., Kolbasov D. V. Genetic and antigenic diversity of african swine fever virus // Virus Res. 2019.
Vol. 271. pp.1-7. http://doi.org/ 10.1016/j.virusres.2019.197673.
Evolution in Europe of African swine fever genotype II viruses from highly to moderately virulent / C. Gallardo, I.
Nurmoja, A. Soler, et al. // Vet. Microbiol. 2018. Vol. 219. P. 70 - 79. http://doi.org/ 10.1016/j.vetmic.2018.04.001.
Tandem repeat sequence in the intergenic region MGF 505 9R/10R is a new marker of the genetic variability
among ASF genotype II viruses / A. Elsukova, I. Shevchenko, A. Varentsova, et al. // Proc. 10th Annual Meeting EPIZONE, 27–29 September 2016. Madrid, 2016. P. 78.
A comparison of viral immune escape strategies targeting the MHC class I assembly pathway / K. Fruh, A. Gruhler, R. M. Krishna, et al. // Immunol. Rev. 1999. 168: p. 157-166. http://doi.org/10.1111/j.1600-065x.1999.tb01290.
Gogin A., Sereda A., Khomenko S. [African swine fever in the Russian Federation (2007–2012): epidemiological review
and consequences for European countries]. Dokument FAO. Rim. 2014; 178: 87.
Stepanov D. V., Goryacheva M. M. [Epizootology of African swine fever in Russia]. Nauka: proshloe, nastojashhee, budushhee. 2017; 55-60.
Cackett G., Matelska D. The African Swine Fever Virus Transcriptome. J Virol. 2020; 94:e00119–20. https://doi.org/
1128/JVI.00119-20.
Karger A., Perez-Nunez D. An Update on African Swine Fever Virology. Viruses. 2019; 11(9): 864. https://doi.org/
3390/v11090864.
Quembo C. J., Jori F., Vosloo W. Genetic Characterization of African Swine Fever Virus Isolates From Soft Ticks at the
Wildlife/Domestic Interface in Mozambique and Identification of a Novel Genotype. Transbound Emerg Dis. 2018; 65: 420-431.
https://doi.org/ 10.1111/tbed.12700.
Yozawa T., Kutish G. F., Afonso C. L. Two novel multigene families, 530 and 300, in the terminal variable regions of
African swine fever virus genome. Virology.1994; 202(2): 997-1002. https://doi.org/ 10.1006/viro.1994.1426.
Nurmoja I., Petrov A., C. Breidenstein Biological characterization of African swine fever virus genotype II strains from
north-eastern Estonia in European wild boar. Transbound. Emerg. Dis. 2017. 64(6): 2034-204. https://doi.org/ 10.1111/
tbed.12614.
O' Donnell V., Holinka L. G., Sanford B. African swine fever virus Georgia isolate harboring deletions of 9GL and
MGF360/505 genes is highly attenuated in swine but does not confer protection against parental virus challenge. Virus Res. 2016;
: 8-14. https://doi.org/ 10.1016/j.virusres.2016.05.014.
Fraczyk M., Wozniakowski G., Kowalczyk A. Evolution of African swine fever virus genes related to evasion of host
immune response. Vet. Microbiol. 2016; 193:133-144. https://doi.org/ 10.1016/j.vetmic.2016.08.018.
Arias M., Torre Ana de la, Dixon A. Approaches and perspectives for development of african swine fever virus vaccines.
Vaccines. 2017; 5 (4): 35. https://doi.org/ 10.3390/vaccines5040035.
Yañez R. J., Rodríguez J. M., Nogal M. L. Analysis of the complete nucleotide sequence of African swine fever virus.
Virology. 2008; 208 (1): 249-278. e01760-16. https://doi.org/ 10.1006/viro.1995.1149.
O’Donnell V., Risatti G. R., Holinka L. G. Simultaneous deletion of the 9GL and UK genes from the African swine fever
virus Georgia 2007 isolate offers increased safety and protection against homologous challenge. J. Virol. 2016; 91 (1). e01760–16.
https://doi.org/ 10.1128/JVI.01760-16.
Sereda A. D., Kolbasov D. V. [Proteins of the African swine fever virus] Nauchnyj zhurnal Kubanskogo GAU. 2012; 3
(77): 534-550.
Selyaninov Yu. O., Senechkina E. K. [Physical mapping of the genome of the African swine fever virus]. Doklady
RASHN. 1995; 2: 37-39.
Selyaninov Yu. O., Balyshev V. M., Tsybanov S. Zh. [African swine fever virus: physical mapping of the genome of
strains]. Vestnik rossijskoj sel'skohozjajstvennoj nauki. 2000; 5: 75-76.
Krug P. W., Holinka L. G., O’Donnell V. The progressive adaptation of a Georgian isolate of african swine fever virus to
Vero cells leads to a gradual attenuation of virulence in swine corresponding to major modification sof the viral genome. J. Virol.
;89 (4):2324-2332. https://doi.org/ 10.1128/JVI.03250-14.
Chapman D. A. G., Tcherepanov V., Upton C. Comparison of the genome sequences of non-pathogenic and pathogenic
African swine fever virus isolates. J. Gen. Virol. 2008; 89 (2): 397- 408. https://doi.org/ 10.1099/vir.0.83343-0.
O’Donnell V., Holinka L. G., Gladue D. P. African swine fever virus Georgia isolate harboring deletions of MGF360 and
MGF505 genes is attenuated in swine and confers protection against challenge with virulent parental virus. J. Virol. 2015; 89
(11): 6048-6056. https://doi.org/ 10.1128/JVI.00554-15.
Malogolovkin A., Kolbasov D. V. Genetic and antigenic diversity of african swine fever virus.Virus Res. 2019; 271:1-7.
https://doi.org/ 10.1016/j.virusres.2019.197673.
Gallardo C., Nurmoja I., Soler A. Evolution in Europe of African swine fever genotype II viruses from highly to moderately virulent. Vet. Microbiol. 2018; 219: 70-79. https://doi.org/ 10.1016/j.vetmic.2018.04.001.
Elsukova A., Shevchenko I., Varentsova A. Tandem repeat sequence in the intergenic region MGF 505 9R/10R is a new
marker of the genetic variability among ASF genotype II viruses. Proc. 10th Annual Meeting EPIZONE, 27–29 September 2016.
Madrid. 2016; 78.
K. Fruh, A. Gruhler, R. M. Krishna A comparison of viral immune escape strategies targeting the MHC class I assembly
pathway. Immunol. Rev. 1999; 168: 157-166. https://doi.org/ 10.1111/j.1600-065x.1999.tb01290.x